第3代的史密斯-韦森3904型手枪是第2代的539型的改进型，是属于39系列中的一款。主要是增加了左右手都能操作的手动保险/待击解脱柄，并把弹匣入口扩大成喇叭形，以方便快速插入弹匣，并把两件式的握把侧板改为一件式的聚合物握把护板（也被称为Xenoy握把套）。该枪配有可调整或固定式的照门供用户选择，重0.85kg，弹匣容量8发。3904型在1988年推出，在1990年停产。

这一把枪的底把标记是3904，不过颜色却像3906，也许是用户或枪匠重新处理过表面的